Już w 1738 roku szwajcarski naukowiec Daniel Bernoulli zastosował metodę różnicy ciśnień-opartą na pierwszym równaniu Bernoulliego-do pomiaru przepływu wody. Później Włoch GB Venturi zbadał zastosowanie rurki Venturiego do pomiaru przepływu i opublikował swoje odkrycia w 1791 roku.
W 1886 roku Amerykanin Clemens Herschel zastosował zasadę rurki Venturiego, aby stworzyć praktyczne urządzenie do pomiaru przepływu wody.
Od początku do połowy XX wieku ustalone zasady pomiaru stopniowo dojrzewały; badacze nie ograniczali się już do istniejących metod, zamiast tego rozpoczęli nowe kierunki badań.
W latach trzydziestych XX wieku zaczęły pojawiać się metody pomiaru prędkości przepływu cieczy i gazów za pomocą fal akustycznych. Jednak przed II wojną światową nie poczyniono znaczących postępów w tej dziedzinie; dopiero w 1955 r. wprowadzono przepływomierz Maxsona-wykorzystujący metodę cyrkulacji akustycznej-do pomiaru przepływu paliwa lotniczego.
Od lat sześćdziesiątych XX wieku oprzyrządowanie do pomiaru przepływu zaczęło ewoluować w kierunku większej precyzji i miniaturyzacji.
Wraz z szybkim rozwojem technologii obwodów scalonych, przepływomierze ultradźwiękowe wykorzystujące technologię-zamkniętej pętli fazowej zyskały szerokie zastosowanie. Co więcej, szerokie zastosowanie mikrokomputerów znacznie zwiększyło możliwości pomiaru przepływu; na przykład integracja mikrokomputerów z laserowymi prędkościomierzami dopplerowskimi umożliwiła przetwarzanie bardziej złożonych sygnałów.